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/http%3A%2F%2Fassets.over-blog.com%2Ft%2Ftwentyeleven%2Fimages%2Fpine-cone.jpg "Un blog pour partager mon expérience de la PCR dans le domaine de la microbiologie, les développements et les FAQ usuelles et quotidiennes que l'on peut avoir avec cette technique.")
Top articles
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Le design d'amorces et de sondes
Nous y voilà... Car il faut être clair, avant de parler de toutes les étapes d'optimisation, de tests, de gamme, de justesse, de validation et autres inhibitions, il faut à la PCR un système d'amorces et de sondes pour borner l'amplicon et assurer la...
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Tester ses amorces...
Le premier post où l'on va pouvoir discuter des amorces et de la manière de les choisir par les résultats obtenus. En effet, comme je le disais précédemment, pas de bonne PCR sans bonnes amorces, c'est la base. Mais comment tester les amorces en temps...
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Les molécules intercalantes : expérience et nouveautés
Une petite revue de détails, j'ai évoqué le test des amorces dans un post précédent avec le Sybr Green, intercalant d'ADN pour amplification non-spécifique. Voici quelques explications rapides et d'autres solutions similaires : Le SybrGreen est une molécule...
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Le monde des fluorophores : Partie 2
Après avoir vu un exemple typique de PCR temps réel utilisant une sonde TaqMan, je vous propose de passer à l'étape supérieur dans ce monde des fluorophores : la Duplex. Tout d'abord, pourquoi réaliser une duplex, c'est à dire 2 systèmes PCR dans le meme...
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Stratégie de sonde : faire son choix !!!
Quand on a bien bossé sur les amorces en Sybr, qu'on est content de la réponse PCR et de la spécificité des courbes de fusion (pics unitaires, pas d'épaulement importants, pas de dimères importants et proches...), la suite est d'ajouter une sonde pour...
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Le monde des fluorophores : Partie 1
Afin de bien comprendre la PCR temps réel et de faire les bons choix stratégiques, il convient de connaitre quelques petites choses dans le monde merveilleux... des fluorophores. Comme dit précédemment, les systèmes PCR temps réel sont composés d'un couple...
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Liens de PCR conventionnelle
Comme dit dans le premier post, je ne ferai pas d'explications de texte de la PCR en tant que telle. Alors aujourd'hui, je vais commencer par la fin des autres, c'est à dire les liens internet. En effet, il existe suffisamment d'informations sur la base...
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Des news de la planète PCR
Aujourd'hui, c'est le premier post concernant la "planète" PCR. J'en ferai de temps en temps, selon mon humeur, par rapport à tout ce qui concerne les acteurs de ce domaine. Et la première info toute fraiche est d'ordre économique. En effet, Invitrogen...
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Le contrôle d'inhibition commercial
Afin d'attendre un peu l'article de fond sur le contrôle d'inhibition et les stratégies que je peux vous livrer, il y a sur le marché des entreprises qui ont développées des solutions commerciales. Historiquement, et à ma connaissance qui n'est pas exhaustive,...
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Le controle d'inhibition compétitif
Bonjour à tous, Après avoir détaillé quelque peu le controle d'inhibition, son utilité et sa version commerciale, le temps est venu d'aborder l'aspect du controle d'inhibition compétitif, plus proche de la séquence cible et donc par voie de fait, plus...
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Rachat de Noël ?
Va falloir lever le pied !!! Une fin d'année avec des actus diverses et variées en BioMol mais toujours aussi vivantes... Bon, je l'avais dit, Applied Biosystem s'est fait racheté par Invitrogen. Jusque là tout va bien. Mais voilà maintenant que Applied...
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Retour de l'été...
La pause estivale se terminant, je vais pouvoir reprendre la rédaction de quelques articles en cours. Je vous promets un article sur l'inhibition depuis quelques temps déjà, je vais tacher de le terminer sous peu. En attendant, je vous signale la publication...
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Publi ou norme?
Je vous parlais du MIQE dernièrement... C'est donc une publication par les scientifiques les plus actifs en ce moment sur les questions de la PCR temps réel. On y retrouve, entre autres, Stephen Bustin, Mike Kubista du TATAA biocentre, Mike Pfaffl, Greg...
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Thermo, Merck : au suivant...
Petite pause business, car mon article sur l'inhibition est assez long à rédiger. Par contre, l'actualité de la World Company de la biotech avance au même rythme que les autres secteurs, plutot vite. Et aussi dans le même sens, celui des gros qui achètent...
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L'inhibition : on y est...
C hose promise, chose écrite, je vais me pencher cette fois-ci sur l'inhibition, sujet suffisamment important et long pour qu'il soit surement traité en plusieurs fois. L'inhibition a déjà été évoquée précédemment dans "le monde des fluorophores partie...
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Les fluorophores et Quenchers : une publication d'intérêt (Marras)
Amis de la PCR, voici la publication du mois de février que j’ai trouvée intéressante en terme de synthèse. Rien de grandement innovant dans celle-ci (ce sera pour plus tard dans les mois à venir) mais un état des lieux des paramètres à prendre en compte...
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Qiagen se paie Corbett
Dans la série Fusion-acquisition du marché de la PCR, la dernière grosse nouvelle est le rachat de Corbett par l'allemand Qiagen (link) Qiagen leader dans les domaines de l'extraction, purification d'acides nucléiques, développe depuis maintenant quelques...
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Retour de pause estivale
Hé bien chers lecteurs (enfin les 2 qui viennent tous les jours en tout cas), me voici de retour pour les suites de l'aventure PCR vu par.....moi. Ce petit post est donc pour vous ragaillardir et vous signaler que les hostilités techniques vont reprendre...
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Ca avance
Le monde des fluorophores est un article que je suis en train d'écrire mais qui se révèle plus ardu et plus dense que je ne le pensais... meme si je savais que je m'attaquais à un bon morceau... Alors pour maintenir mes 2 lecteurs quotidiens en état de...
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English version? yes thank you...
En attendant la suite des posts techniques, voici la version anglaise de "PCR & compagnie" que je viens de lancer : http://q-pcr.blogspot.com/ Pour le moment, ça n'est qu'une traduction de ce que vous pouvez lire sur ce blog. Mais vous pouvez vous en...
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English version of this blog
Bonjour à tous, Hi all, Trying to update this blog as often as I can maintaining a scientific quality, I know that every people reading this blog do not speak enough good french to understand everything correclty. To solve that, I started an english version...
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Quand je vous parlais de Thermo...
En mars dernier, je vous parlais déjà de Thermo qui venait de racheter Finnzymes...et que probablement il ne s'arrêterait pas là pour aller creuser un peu plus du coté de la BioMol... Et bien c'est chose faite !!! Comme le révèle cet article , Thermo...
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L'inhibition en qPCR
Bientot sur ces pages, un topo sur l'inhibition en qPCR, et peut etre des exemples de RT-qPCR également. Il y aura des courbes, des essais, et des avis aussi. Toute la difficulté d'identifier l'inhibition, mais aussi de s'en affranchir si possible. N'hésitez...
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LA PCR temps réel
Maintenant que vous avez lu quelques liens sur la PCR dite conventionnelle histoire de se rafraichir la mémoire, je vous donne aujourd'hui quelques liens plus spécifiques à la PCR temps réel. * Un petit point à ce sujet qui vaudra pour tous les articles...
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Controle d'inhibition en PCR revient bientot
Bonjour à tous, le temps a été long depuis le dernier post... mais les affaires vont reprendre très bientot. Outre le "promis" sur le controle d'inhibition, plein de nouveaux articles vont pouvoir voir le jour avec ce qui s'est passé depuis : - la digitale...